MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azorhizobium caulinodans ORS 571 chromosome

Total Repeats: 142977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009937	GCG	2	6	9	14	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009937	TCT	2	6	18	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009937	GCTC	2	8	72	79	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009937	CA	3	6	85	90	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009937	TCA	2	6	94	99	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009937	AG	3	6	119	124	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009937	CG	3	6	156	161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009937	CGG	2	6	191	196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009937	CCG	2	6	234	239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009937	GGAT	2	8	319	326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009937	ATGCCC	2	12	332	343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009937	TGC	2	6	354	359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421625
13	NC_009937	AGC	2	6	426	431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421625
14	NC_009937	ACT	2	6	442	447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421625
15	NC_009937	CCA	2	6	565	570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421625
16	NC_009937	AGC	2	6	571	576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421625
17	NC_009937	TGG	2	6	631	636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421625
18	NC_009937	GGT	2	6	710	715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421625
19	NC_009937	GCG	2	6	739	744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421625
20	NC_009937	GTGG	2	8	759	766	0 %	25 %	75 %	0 %	158421625
21	NC_009937	GAC	2	6	831	836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421625
22	NC_009937	GACG	2	8	845	852	25 %	0 %	50 %	25 %	158421625
23	NC_009937	GTG	2	6	870	875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421625
24	NC_009937	CTG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421625
25	NC_009937	ATCT	2	8	915	922	25 %	50 %	0 %	25 %	158421625
26	NC_009937	CCG	2	6	978	983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421625
27	NC_009937	GAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421625
28	NC_009937	TCG	2	6	1012	1017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421625
29	NC_009937	TCG	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421625
30	NC_009937	CTC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421625
31	NC_009937	GGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421625
32	NC_009937	CCG	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421625
33	NC_009937	GAG	2	6	1200	1205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421625
34	NC_009937	GCC	3	9	1209	1217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421625
35	NC_009937	ATC	2	6	1218	1223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421625
36	NC_009937	TC	3	6	1229	1234	0 %	50 %	0 %	50 %	158421625
37	NC_009937	GCG	2	6	1238	1243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421625
38	NC_009937	CGG	2	6	1245	1250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421625
39	NC_009937	TCG	2	6	1255	1260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421625
40	NC_009937	GCCT	2	8	1278	1285	0 %	25 %	25 %	50 %	158421626
41	NC_009937	GCT	3	9	1291	1299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421626
42	NC_009937	CCGC	2	8	1314	1321	0 %	0 %	25 %	75 %	158421626
43	NC_009937	CGA	2	6	1375	1380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421626
44	NC_009937	CGC	2	6	1462	1467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421626
45	NC_009937	CGGGT	2	10	1482	1491	0 %	20 %	60 %	20 %	158421626
46	NC_009937	GCC	2	6	1543	1548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421626
47	NC_009937	GCC	2	6	1559	1564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421626
48	NC_009937	GCCG	2	8	1586	1593	0 %	0 %	50 %	50 %	158421626
49	NC_009937	AG	3	6	1702	1707	50 %	0 %	50 %	0 %	158421626
50	NC_009937	CGC	2	6	1714	1719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421626
51	NC_009937	GGGTT	2	10	1861	1870	0 %	40 %	60 %	0 %	158421626
52	NC_009937	AGC	2	6	1946	1951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421627
53	NC_009937	ACG	2	6	1979	1984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421627
54	NC_009937	CGAAGC	2	12	1995	2006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421627
55	NC_009937	CTT	2	6	2007	2012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421627
56	NC_009937	CG	3	6	2013	2018	0 %	0 %	50 %	50 %	158421627
57	NC_009937	CGG	2	6	2040	2045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421627
58	NC_009937	GGA	2	6	2142	2147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421627
59	NC_009937	CGGC	2	8	2148	2155	0 %	0 %	50 %	50 %	158421627
60	NC_009937	GCGG	2	8	2254	2261	0 %	0 %	75 %	25 %	158421627
61	NC_009937	CTTC	2	8	2286	2293	0 %	50 %	0 %	50 %	158421627
62	NC_009937	TGC	2	6	2312	2317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421627
63	NC_009937	GTG	2	6	2374	2379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421627
64	NC_009937	AGG	2	6	2414	2419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421627
65	NC_009937	GGT	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421627
66	NC_009937	GCC	2	6	2463	2468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421627
67	NC_009937	GAT	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421627
68	NC_009937	GTG	2	6	2506	2511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421627
69	NC_009937	GGC	2	6	2553	2558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421627
70	NC_009937	TGC	3	9	2597	2605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421627
71	NC_009937	CGC	2	6	2645	2650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421627
72	NC_009937	TCG	2	6	2678	2683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421627
73	NC_009937	ATC	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421628
74	NC_009937	CCG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421628
75	NC_009937	CGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421628
76	NC_009937	ATG	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421628
77	NC_009937	CCATG	2	10	2827	2836	20 %	20 %	20 %	40 %	158421628
78	NC_009937	GGC	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421628
79	NC_009937	ATCG	2	8	2900	2907	25 %	25 %	25 %	25 %	158421628
80	NC_009937	GC	3	6	2995	3000	0 %	0 %	50 %	50 %	158421628
81	NC_009937	GGC	2	6	3019	3024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421628
82	NC_009937	GTG	2	6	3038	3043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421628
83	NC_009937	GTC	3	9	3092	3100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421628
84	NC_009937	CG	3	6	3159	3164	0 %	0 %	50 %	50 %	158421628
85	NC_009937	GCC	2	6	3213	3218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421628
86	NC_009937	TCA	2	6	3228	3233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421628
87	NC_009937	CCGG	2	8	3240	3247	0 %	0 %	50 %	50 %	158421628
88	NC_009937	CCT	2	6	3280	3285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421628
89	NC_009937	CA	3	6	3308	3313	50 %	0 %	0 %	50 %	158421628
90	NC_009937	ACC	2	6	3368	3373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421629
91	NC_009937	CAA	2	6	3385	3390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158421629
92	NC_009937	GTG	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421629
93	NC_009937	CGG	2	6	3489	3494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421629
94	NC_009937	GAGT	2	8	3520	3527	25 %	25 %	50 %	0 %	158421629
95	NC_009937	GTG	2	6	3683	3688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421629
96	NC_009937	CGCC	2	8	3703	3710	0 %	0 %	25 %	75 %	158421629
97	NC_009937	CGA	2	6	3739	3744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421629
98	NC_009937	TGA	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158421629
99	NC_009937	GCT	2	6	3796	3801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421629
100	NC_009937	CTG	2	6	3812	3817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421629
101	NC_009937	CGGC	2	8	3844	3851	0 %	0 %	50 %	50 %	158421629
102	NC_009937	TCG	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421629
103	NC_009937	GCGCC	2	10	3890	3899	0 %	0 %	40 %	60 %	158421629
104	NC_009937	GTG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421629
105	NC_009937	GGTGGC	2	12	3910	3921	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158421629
106	NC_009937	CGC	2	6	3973	3978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421629
107	NC_009937	CGG	2	6	3994	3999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421629
108	NC_009937	TGG	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421629
109	NC_009937	GC	3	6	4095	4100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009937	CGCC	2	8	4117	4124	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_009937	AGA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009937	AGA	2	6	4176	4181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421630
113	NC_009937	GCCT	2	8	4183	4190	0 %	25 %	25 %	50 %	158421630
114	NC_009937	CCG	2	6	4250	4255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421630
115	NC_009937	GGA	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421630
116	NC_009937	CAT	2	6	4359	4364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421630
117	NC_009937	CAC	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421630
118	NC_009937	GAG	2	6	4474	4479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421630
119	NC_009937	CGCC	2	8	4503	4510	0 %	0 %	25 %	75 %	158421630
120	NC_009937	TCG	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421630
121	NC_009937	GAG	2	6	4567	4572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421630
122	NC_009937	GAG	2	6	4617	4622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421631
123	NC_009937	GGGCGT	2	12	4703	4714	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	158421631
124	NC_009937	CGG	2	6	4773	4778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421631
125	NC_009937	CCT	2	6	4787	4792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421631
126	NC_009937	GC	3	6	4843	4848	0 %	0 %	50 %	50 %	158421631
127	NC_009937	CGG	2	6	4849	4854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421631
128	NC_009937	CTGG	2	8	4892	4899	0 %	25 %	50 %	25 %	158421631
129	NC_009937	GTG	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421631
130	NC_009937	GCTC	2	8	4915	4922	0 %	25 %	25 %	50 %	158421631
131	NC_009937	TTC	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158421631
132	NC_009937	CGC	2	6	5054	5059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421631
133	NC_009937	GGT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421631
134	NC_009937	ACGG	2	8	5109	5116	25 %	0 %	50 %	25 %	158421631
135	NC_009937	CGC	2	6	5171	5176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421631
136	NC_009937	GTC	2	6	5190	5195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421631
137	NC_009937	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421631
138	NC_009937	CCT	2	6	5263	5268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421631
139	NC_009937	TGC	2	6	5308	5313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421631
140	NC_009937	ATGACC	2	12	5368	5379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158421631
141	NC_009937	CGC	2	6	5396	5401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421631
142	NC_009937	GCA	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421631
143	NC_009937	ACGCA	2	10	5496	5505	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_009937	CG	3	6	5552	5557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_009937	GAC	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009937	AGG	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421632
147	NC_009937	CGG	2	6	5699	5704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421632
148	NC_009937	GCC	2	6	5749	5754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421632
149	NC_009937	ACC	2	6	5815	5820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421632
150	NC_009937	GTG	2	6	5881	5886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421632
151	NC_009937	GTG	2	6	5893	5898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421632
152	NC_009937	ATC	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421632
153	NC_009937	CCG	2	6	5978	5983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421632
154	NC_009937	ACC	2	6	5996	6001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421632
155	NC_009937	GCG	2	6	6016	6021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421632
156	NC_009937	AAG	2	6	6028	6033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421632
157	NC_009937	CGT	2	6	6093	6098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421632
158	NC_009937	G	6	6	6110	6115	0 %	0 %	100 %	0 %	158421632
159	NC_009937	CG	3	6	6157	6162	0 %	0 %	50 %	50 %	158421632
160	NC_009937	TGG	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421632
161	NC_009937	CGGA	2	8	6233	6240	25 %	0 %	50 %	25 %	158421632
162	NC_009937	GCT	2	6	6261	6266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421632
163	NC_009937	ACC	2	6	6310	6315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421632
164	NC_009937	CGC	2	6	6348	6353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421632
165	NC_009937	ATC	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421632
166	NC_009937	GC	3	6	6480	6485	0 %	0 %	50 %	50 %	158421632
167	NC_009937	CCGG	2	8	6489	6496	0 %	0 %	50 %	50 %	158421632
168	NC_009937	GTC	2	6	6507	6512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421632
169	NC_009937	TCG	2	6	6521	6526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421632
170	NC_009937	CGCC	2	8	6573	6580	0 %	0 %	25 %	75 %	158421632
171	NC_009937	TCCG	2	8	6620	6627	0 %	25 %	25 %	50 %	158421632
172	NC_009937	CGG	3	9	6635	6643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421632
173	NC_009937	ACC	2	6	6650	6655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421632
174	NC_009937	AGCG	2	8	6676	6683	25 %	0 %	50 %	25 %	158421632
175	NC_009937	CGCC	2	8	6687	6694	0 %	0 %	25 %	75 %	158421632
176	NC_009937	CGT	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421632
177	NC_009937	CT	3	6	6897	6902	0 %	50 %	0 %	50 %	158421632
178	NC_009937	GTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158421632
179	NC_009937	CCGC	2	8	6951	6958	0 %	0 %	25 %	75 %	158421632
180	NC_009937	GGCCC	2	10	7029	7038	0 %	0 %	40 %	60 %	158421633
181	NC_009937	GCC	2	6	7041	7046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421633
182	NC_009937	CAC	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158421633
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184	NC_009937	GAC	2	6	7107	7112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421633
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186	NC_009937	GGCG	2	8	7221	7228	0 %	0 %	75 %	25 %	158421633
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188	NC_009937	TTCGAC	2	12	7353	7364	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	158421633
189	NC_009937	CGA	2	6	7388	7393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158421633
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192	NC_009937	CG	3	6	7452	7457	0 %	0 %	50 %	50 %	158421633
193	NC_009937	CCGG	2	8	7491	7498	0 %	0 %	50 %	50 %	158421633
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198	NC_009937	CAT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421633
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215	NC_009937	GCC	2	6	8452	8457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421634
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230	NC_009937	CTG	2	6	9019	9024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421635
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252	NC_009937	GCCG	2	8	9675	9682	0 %	0 %	50 %	50 %	158421635
253	NC_009937	TCC	2	6	9873	9878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158421636
254	NC_009937	CG	3	6	9898	9903	0 %	0 %	50 %	50 %	158421636
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257	NC_009937	CCG	3	9	9939	9947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421636
258	NC_009937	CCTC	2	8	9978	9985	0 %	25 %	0 %	75 %	158421636
259	NC_009937	TGG	2	6	9986	9991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421636
260	NC_009937	TGG	2	6	10008	10013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158421636
261	NC_009937	GGA	2	6	10018	10023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158421636
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264	NC_009937	CGG	2	6	10161	10166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158421636
265	NC_009937	TCG	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421636
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267	NC_009937	CTG	2	6	10295	10300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421636
268	NC_009937	CTG	3	9	10319	10327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158421636
269	NC_009937	GGGC	2	8	10350	10357	0 %	0 %	75 %	25 %	158421636
270	NC_009937	CAT	2	6	10459	10464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158421636
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273	NC_009937	GC	3	6	10554	10559	0 %	0 %	50 %	50 %	158421636
274	NC_009937	GC	3	6	10649	10654	0 %	0 %	50 %	50 %	158421636
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298	NC_009937	GA	3	6	11432	11437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
299	NC_009937	AAG	2	6	11446	11451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158421637
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382	NC_009937	GATC	2	8	14930	14937	25 %	25 %	25 %	25 %	158421640
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386	NC_009937	CGC	2	6	15098	15103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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388	NC_009937	T	6	6	15195	15200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
389	NC_009937	CGG	2	6	15212	15217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_009937	CGC	2	6	15221	15226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
391	NC_009937	GC	3	6	15239	15244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
392	NC_009937	TCG	3	9	15343	15351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
393	NC_009937	TGA	2	6	15356	15361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
394	NC_009937	CCGG	2	8	15371	15378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
395	NC_009937	GC	3	6	15477	15482	0 %	0 %	50 %	50 %	158421641
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397	NC_009937	CGC	2	6	15577	15582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158421641
398	NC_009937	GC	3	6	15581	15586	0 %	0 %	50 %	50 %	158421641
399	NC_009937	GC	3	6	15653	15658	0 %	0 %	50 %	50 %	158421641
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